Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz2Q9JHH9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz2Q9JHH9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms