Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a4aQ9ET37 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a4aQ9ET37 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a4aQ9ET37 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms