Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm9sf3Q9ET30 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm9sf3Q9ET30 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms