Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3bQ9ES34 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3bQ9ES34 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ube3bQ9ES34 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms