Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf23Q9ER63 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms