Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr9Q9EQU3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr9Q9EQU3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms