Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Ndst3Q9EQH7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ndst3Q9EQH7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndst3Q9EQH7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ndst3Q9EQH7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Ndst3Q9EQH7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Ndst3Q9EQH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Ndst3Q9EQH7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Ndst3Q9EQH7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndst3Q9EQH7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndst3Q9EQH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms