Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rpgrip1Q9EPQ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rpgrip1Q9EPQ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms