Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SyncQ9EPM5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SyncQ9EPM5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SyncQ9EPM5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms