Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp1bQ9EPL6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp1bQ9EPL6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms