Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp13a1Q9EPE9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a1Q9EPE9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms