Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl4Q9DCU6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mrpl4Q9DCU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl4Q9DCU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms