Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ergic1Q9DC16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ergic1Q9DC16 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic1Q9DC16 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms