Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tm9sf1Q9DBU0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tm9sf1Q9DBU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms