Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg8Q9DBM0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg8Q9DBM0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcg8Q9DBM0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcg8Q9DBM0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg8Q9DBM0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcg8Q9DBM0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms