Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SelenooQ9DBC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SelenooQ9DBC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SelenooQ9DBC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms