Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Med29Q9DB91 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med29Q9DB91 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med29Q9DB91 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms