Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asf1bQ9DAP7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Asf1bQ9DAP7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asf1bQ9DAP7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms