Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc89Q9DA73 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc89Q9DA73 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms