Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Actrt1Q9D9J3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Actrt1Q9D9J3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Actrt1Q9D9J3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms