Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc70Q9D9B0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc70Q9D9B0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms