Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc70Q9D9B0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc70Q9D9B0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc70Q9D9B0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms