Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx5Q9D8U8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms