Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rexo2Q9D8S4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo2Q9D8S4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms