Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl3Q9D8K3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl3Q9D8K3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms