Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc52a2Q9D8F3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc52a2Q9D8F3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Slc52a2Q9D8F3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms