Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms