Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jam3Q9D8B7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms