Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fip1l1Q9D824 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fip1l1Q9D824 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms