Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc9bQ9D6E4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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