Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lpcat2bQ9D5U0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lpcat2bQ9D5U0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lpcat2bQ9D5U0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms