Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn11Q9D572 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn11Q9D572 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms