Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3404Q9D506 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3404Q9D506 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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