Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D4W2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms