Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf6Q9D4J7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms