Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syce1Q9D495 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1Q9D495 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms