Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpn3Q9D3W4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpn3Q9D3W4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpn3Q9D3W4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms