Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Obox1Q9D350 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Obox1Q9D350 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Obox1Q9D350 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Obox1Q9D350 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox1Q9D350 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Obox1Q9D350 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Obox1Q9D350 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Obox1Q9D350 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Obox1Q9D350 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Obox1Q9D350 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Obox1Q9D350 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms