Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt20Q9D312 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt20Q9D312 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms