Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt44Q9D2Q2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt44Q9D2Q2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms