Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms