Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbr1lQ9D1E5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmbr1lQ9D1E5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms