Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Syf2Q9D198 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syf2Q9D198 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syf2Q9D198 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syf2Q9D198 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syf2Q9D198 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms