Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp2Q9CYZ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms