Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sgo1Q9CXH7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Sgo1Q9CXH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Sgo1Q9CXH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Sgo1Q9CXH7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sgo1Q9CXH7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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