Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tmed5Q9CXE7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed5Q9CXE7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms