Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Xrcc3Q9CXE6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xrcc3Q9CXE6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
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Xrcc3Q9CXE6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Xrcc3Q9CXE6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Xrcc3Q9CXE6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Xrcc3Q9CXE6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Xrcc3Q9CXE6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Xrcc3Q9CXE6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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