Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mgme1Q9CXC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mgme1Q9CXC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms