Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin4Q9CWW6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin4Q9CWW6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin4Q9CWW6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms