Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CWU4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CWU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CWU4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CWU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.6 ms