Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1aQ9CU62 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1aQ9CU62 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms